Quy chế phối hợp giữa Công an và Trung tâm y tế là trao đổi thông tin liên quan đến công tác đảm bảo trật tự an toàn xã hội, phòng ngừa tội phạm và các vi phạm pháp luật trong Trung tâm Y tế. Giải quyết tố giác tin báo về tội phạm, kiến nghị khởi tố trong lĩnh vực y tế, trao đổi thông tin giải quyết các vụ việc có dấu hiệu về tội phạm xảy ra hoặc có liên quan đến Trung tâm Y tế như: Hành vi trộm cắp tài sản, chống người thi hành công vụ, cố ý gây thương tích, tử vong chưa rõ nguyên nhân, tử vong có dấu hiệu nghi do hành vi, vi phạm pháp luật, hành vi gây rối trật tự, tai nạn giao thông, tai nạn lao động, sơ cứu, cấp cứu các trường hợp nạn nhân bị thương tích nặng, tai nạn nguy hiểm đến tính mạng nghi là hậu quả của các hành vi vi phạm pháp luật gây ra, xâm hại sức khỏe, giết người, tai nạn giao thông…

Nguyên tắc phối hợp giữa 2 cơ quan, trên cơ sở tuân thủ các chủ trương đường lối của Đảng chính sách pháp luật của Nhà nước, các quy định của Bộ Công an, Bộ Y tế và các văn bản pháp luật khác có liên quan. Quá trình phối hợp thường xuyên, liên tục, kịp thời đảm bảo các yêu cầu về pháp luật, chính trị, nghiệp vụ và tạo điều kiện thuận lợi cho công tác chăm sóc bảo vệ sức khỏe nhân dân. Góp phần đẩy mạnh phong trào toàn dân bảo vệ an ninh Tổ quốc, nâng cao hiệu quả công tác đấu tranh phòng chống tội phạm, đảm bảo an ninh trật tự tại địa phương.